Shiatsu zlepšuje funkci vnitřních orgánů, krevního oběhu a lymfatického systému. Podporuje a aktivuje samouzdravující procesy v těle a jeho nervovém systému, pomáhá při regulaci hormonálního rovnováhy a odbourává stres.
Typické obtíže, při kterých je Shiatsu velmi účinné, jsou například bolesti hlavy, šíje a zad, svalové napětí, ztuhlost a bolest kloubů, nespavost, menstruační poruchy a obtíže v menopauze, trávicí potíže, nedostatečná odolnost vůči infekcím, posílení a regenerace organismu po nemocech a zranění, syndrom vyhoření, úzkost a deprese, chronické únavové stavy, změny životního stylu a životní krize.